Angenommen, man hat zwei Dateien (mit dem gleichen Format) kann man diese durch diesen Aufruf zusammenführen:
mencoder -oac copy -ovc copy DATEINAME1.AVI DATEINAME2.AVI -o AUSGABE.AVI
Wichtig ist immer die Groß- und Kleinschreibung zu beachten.
Mehr zu MEncoder unter: https://wiki.ubuntuusers.de/MEncoder/